La compatibilité étendue des fichiers d'importation et d'exportation de Global Mapper en fait l'une des applications S.I.G. les plus interopérables actuellement disponibles et un outil indispensable pour tous les professionnels du S.I.G..
La liste suivante décrit les formats de données actuellement pris en charge :
Bases de donnée spatiales
Formats 3D
Formats d’altitude maillés
Formats raster (imagerie, cartes scannées)
Formats vectoriels